IT-решения против онкологии: как IT помогает науке бороться с раком
Ученые исследуют способы для диагностики рака, которые могли бы давать о биологических тканях больше информации, чтобы замечать изменения на ранних стадиях. Один из современных методов исследования ткани — оптическая биопсия.
Оптическая биопсия дает больше подробных данных
Оптическая биопсия позволяет исследовать биологические ткани с помощью лазера, не отделяя их от организма. Это быстрее, так как не требуется проводить хирургическое вмешательство или обрабатывать образцы, менее травматично, поскольку не требует разрезов и заживления. Но главное преимущество в том, что такой подход обеспечивает большую точность.
Что еще важно — исследователи могут наблюдать изменения в живой ткани в реальном времени. Например, они могут видеть, как опухоль увеличивается, как изменяются границы между здоровыми и больными участками, что позволяет быстрее реагировать на происходящее.
Вот исследование: результаты, полученные методом оптической биопсии при диагностике рака, на 96% точнее, чем полученные традиционной гистологией. На картинке снимки тканей молочной железы: сверху снимок получен стандартным гистологическим методом, снизу с помощью инструментов оптической биопсии, и на ней скопления опухолевых клеток и границы переходов видны гораздо четче.
Чтобы применять такой метод при исследованиях и диагностике, нужны инструменты для анализа томографических снимков.
Что разработали ИТ-специалисты
Riverstart вместе с учеными ИПФ РАН — специалистами компании «Оптикэластограф» — создали веб-платформу OpticElastograph, которая позволяет применять метод оптической биопсии и автоматически получать информацию с томограмм о состоянии тканей — более подробную, чем дает обычное гистологическое исследование.
С ней можно точнее поставить диагноз, увидеть четкие края опухоли. провести более точную операцию и сохранить орган, вырезав только раковые клетки.
Как это работает?
Ученые создали программы для обработки сканов. Они могут визуализировать кровеносные сосуды, находить зависимости между параметрами, строить карты деформаций и жесткости тканей и прочее.
Riverstart спроектировали вычислительный кластер, который разворачивается в любом облачном дата-центре и обрабатывает данные в контейнерном исполнении.
Все вместе это веб-платформа OpticElastograph, которая позволяет запускать программы для обработки томограмм не на компьютере ученого, а в вебе. Исследователи могут пользоваться сервисом из личного кабинета, хранить информацию, запускать пакетную обработку сканов, делиться с коллегами, собирать базы данных для обучения ML-моделей. Даже моделировать новые сканы с помощью отдельных настроек на платформе OpticElastograph.
Все это дает возможность проводить исследования в онкологии, получать гораздо более широкие данные о биотканях, быстрее и точнее подобрать лечение и увеличивать шансы сохранить орган при операции. Кроме онкологии данные такого порядка нужны в хирургии, косметологии, разработке и тестировании лекарств.
Подробно про устройство и работу самой платформы можно почитать по ссылке, там больше скриншотов и деталей.